MinION

Le minION, de la société Oxford Nanopore Technologies, permet le séquençage de molécules individuelles par l’enregistrement et l’interprétation de la variation d’un potentiel appliqué au travers d’une membrane lorsque ces molécules  traversent cette membrane au niveau de pores.

L’appareil contient 512 pores et permet de générer des séquences de plusieurs dizaines de kb.

La capacité théorique de séquençage est de l’ordre de 20 Gb (plutôt < 15 Gb en pratique).

Les applications sont :

  • Séquençage de génomes eucaryotes
  • Séquençage de génomes bactériens
  • Séquençage d’amplicons longs (10-30 kb, mitochondries…)
  • Séquençage d’ARN (RNA-seq, variants structuraux…)

Responsable de ces applications : J. Briolay