Oligo 7

Logiciel de conception d’oligonucléotide pour la PCR ou qPCR, le séquençage, l’hybridation ou de sondes.

Ce logiciel permet :

  • de concevoir des oligos pour PCR (Polymerase Chain Reaction) ou LCR (Ligase Chain Reaction)
  • concevoir un oligo compatible avec un oligo existant
  • conception de sondes TaqMan (hydrolyse) ou Molecular Beacons
  • stabilité interne (delta G)
  • de vérifier leur non-dimérisation ou d’épingle à cheveux (hairpin)
  • recherche de motifs
  • d’éliminer des motifs fréquemment représentés dans un génome donné
  • de tenir compte d’une liste de séquence présente dans un fichier
  • de vérifier leur hybridation sur des sites secondaires (false priming sites)
  • le calcul du Tm, composition en bases
  • calcul du temps d’hybridation optimal (sondes)
  • compatibilité en multiplex
  • 35 codes génétiques gérés
  • traduction en protéines
  • recherche d’ORF
  • analyse de restriction

Ce logiciel est à disposition sur un poste informatique en accès libre avec réservation.