QX-100-200

Le système QX 100 de BioRad est un appareil de qPCR digitale en émulsion.

Cet appareil à été upgradé (QX 200) pour permettre l’utilisation d’un marquage en SYBR Green.

Il permet la quantification absolue de cibles d’ADN sans gamme étalon. L’échantillon et son mix de PCR est émulsionné, dans une huile spéciale par un générateur de gouttelettes, ce qui crée un partitionnement de son contenu en ADN. Il subit ensuite une PCR en point final (dans un appareil de PCR standard). Enfin, la lecture de la fluorescence des gouttelettes est faite par un lecteur qui analyse successivement la fluorescence de chaque gouttelette. Le partitionnement de l’échantillon permet une augmentation de la sensibilité par rapport à un appareil de qPCR classique. On regarde ici uniquement si la PCR est positive ou négative. Le logiciel associé calcule la fraction du partitionnement positif puis estime la concentration de cible initiale par modélisation d’une distribution selon une loi de Poisson.

Applications :

  • Variation du nombre de copies
  • Détection de cibles peu fréquentes
  • Détection de mutations
  • Expression de transcrits rares
  • Analyse de miRNA
  • Quantification de librairies NGS

Cet appareil a été acquis pour le DTAMB par un financement de la fédération BioEnviS.

Vos contacts : Fabiola Bastian et Cécile Jacot des Combes