Le reséquençage implique de posséder une séquence de référence. La reconstitution d’un grand fragment ou d’un génome se fait par alignement des reads sur cette séquence de référence. Cette procédure est utilisée pour la recherche de mutations sur l’ensemble d’un génome ou la reconstitution de génomes d’espèces phylogénétiquement très proches du modèle.
Matériel requis :
- ADN génomique pur
Type de séquençage :
- Sur Illumina MiSeq (paired-end en 2x300pb ou autre)
Résultats fournis :
- Données brutes (fichiers au format fastq)
- Contigs / Scaffolds (format fasta)