La MLST (MultiLocus Sequence Typing) consiste à séquencer un ensemble de fragments d’ADN, amplifiés par PCR, provenant d’autant de gènes de ménage. Pour chaque fragment, des séquences différentes représenteront des allèles différents. L’ensemble des séquences obtenues pour une souche donnée correspond à un profil caractéristique que l’on peut représenter par un codage (taxonomie).
Concernant la MLSA (MultiLocus Sequence Analysis), le principe est le même mais il n’y a pas de codage final. Les séquences sont utilisées en tant que telles dans la suite des analyses (phylogénie).
Informations pratiques :
Pour les utilisateurs locaux, merci d’apporter vos échantillons au DTAMB. Ils seront transmis par levée journalière (vers 18h) dans les locaux de Biofidal. Pour les clients extérieurs, merci de les envoyer directement sur le site de Vaulx-en-Velin (adresse ici).