Le P2 solo, de la société Oxford Nanopore Technologies est un séquenceur fonctionnant avec la technologie de séquençage nanopore comme les séquenceurs Minion déjà présents au DTAMB.
Le P2 solo fonctionne avec des flowcell de type PromethION. Une flowcell PromethION permet de générer jusqu’à 100-200 Gb de données de séquençage à partir d’ADN génomique. Ces flowcell contiennent jusqu’à 2675 pores pour le séquençage, c’est environ 5 fois plus que les flowcell MinION.
Le P2 Solo est un petit appareil de table conçu pour faire fonctionner jusqu’à deux flowcell PromethION pouvant fonctionner indépendamment.
Acquisition : l’appareil a été acquis en 2023 dans le cadre d’un financement FR.
Applications :
- Séquençage de génomes eucaryotes ou bactérien
- Séquençage de génomes de plusieurs Gb (jusqu’à ~3 Gb)
- Séquençage d’amplicons longs (10-30 kb, mitochondries…)
- Séquençage d’ARN (RNA-seq, variants structuraux…)
Responsable de ces applications : E. Ponsardin