Le BioRad QX100 du DTAMB est un appareil de PCR digitale (QX100 Droplet Digital PCR) qui permet une sensibilité accrue grâce au partitionnement de l’échantillon en microgouttelettes. Il permet également d’effectuer des qPCR et RT-qPCR en quantification absolue (sans gamme étalon ni gène de référence). Il est adapté aux qPCR simplex ou duplex avec sondes fluorescentes. Il vient d’être upgradé …
Upgrade du Xenius Safas
Le spectrofluorimètre Safas Xenius du DTAMB est un appareil haut de gamme d’une grande sensibilité. Il était cependant vieillissant et nécessitait des améliorations. C’est chose faite. Toute l’optique a été remise à un niveau identique à un appareil neuf. De plus, une agitation des microplaques lui a été ajoutée grace au remplacement du système de guidage des microplaques par une …
Nouveau pipeline d’assemblage de novo
Mise en place d’un nouveau pipeline d’assemblage de novo de génomes bactériens. Il implique l’utilisation successive de 5 assembleurs puis d’un méta-assembleur et à donné de très bons résultats pour l’assemblage d’E. coli, de Pseudomonas et de Stenotrophomonas par exemple.
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