L’enrichissement de séquences permet d’extraire d’un milieu complexe () un sous-ensemble de séquences (groupe de gènes, exome…) d’intérêt permettant un séquençage ciblé. En outre, la profondeur de séquençage atteinte est supérieure et améliore donc la sensibilité de détection. La procédure utilise typiquement un ensemble de sondes biotinylées dessinées spécifiquement en fonction de l’étude à réaliser.
Voir également Panels.
Informations pratiques :
Echantillons
Les échantillons doivent être fournis dans de l’eau ou du TE. Des contaminants variés (sels, composés organiques, métaux …) peuvent interférer et conduire à de mauvais résultats.
Vos échantillons (500 ng) seront conditionnés dans un volume minimum de 30 µl en tubes de 0,5 – 1,5 ml ou 0,2 ml individuels ou en barrettes. Ils seront, dès leur arrivée, transférés dans un congélateur jusqu’à l’analyse.
Demandez un devis.
Type de séquençage
- Sur Illumina MiSeq
Résultats
- Données brutes (fichiers au format fastq)
- Recherche des SNPs (tableau au format .txt ou .csv)