Appareils de PCR en temps réel à 96 puits de la marque BioRad (SybrGreen, TaqMan, autres sondes…).
Acquisition : trois appareils acquis en 2009 et 2016 pour le DTAMB par la fédération BioEEnviS. Un appareil 2 couleurs, le CFX connect, et deux appareils 6 couleurs, le CFX96 DX et le CFX96 Touch.
Applications :
- qPCR en quantification absolue
- qPCR en quantification relative
- Courbes de fusion
- HRM (High Resolution Melting)
- Possibilité de travailler en gradient de température.
Logiciels :
Il existe deux versions du logiciel pour le pilotage et l’analyse de données générés sur les CFX : le logiciel CFX manager (version plus ancienne) et le logiciel CFX Maestro (version récente). Les deux logiciels sont très similaires mais le CFX Maestro apporte quelques fonctionnalités supplémentaires par rapport à son prédécesseur : un outil de sélection de gènes de référence, et un outil d’analyse statistique (couplé à une optimisation de l’éditeur de plan de plaque).
Pour installer les logiciels sur votre ordinateur, vous pouvez vous adresser aux personnels du DTAMB qui vous fourniront les exécutables.
Le DTAMB met à disposition un mode opératoire pour la prise en main du logiciel CFX Maestro : DTAMB-Mode operatoire logiciel qPCR Maestro_v1. Ce mode opératoire permet également la prise en main du logiciel CFX Manager.
Prestation :
Le DTAMB propose des prestations de qPCR sur ces appareils pour de la quantification relative ou absolue. Pour plus d’informations, voir dans Informations pratiques ci-dessous.
Informations pratiques :
Echantillons :
Les échantillons doivent être fournis dans de l’eau ou du TE. Leur qualité doit avoir été vérifié au préalable ou en faire la demande comme prestation supplémentaire. Des contaminants variés (sels, composés organiques, métaux …) peuvent interférer et conduire à de mauvais résultats. Les échantillons doivent êtres non dégradés et pures.
Vos échantillons seront conditionnés en microtubes de 0,2 – 0,5 ou dans des tubes de 1,5 ml.
Merci de fournir, avec vos échantillons, un descriptif (nom, position) sous forme d’un fichier Excel que vous trouverez ici : BC_qPCRddPCR
Pour cette prestation, merci de demander un devis.
Merci d’apporter ou d’envoyer vos échantillons au DTAMB.
Résultats :
Les résultats bruts seront fournis avec un rapport au format pdf.
Si besoin, les résultats bruts ainsi que des données analysés peuvent être fournis.