Le minION, de la société Oxford Nanopore Technologies, permet le séquençage de molécules individuelles par l’enregistrement et l’interprétation de la variation d’un potentiel appliqué au travers d’une membrane lorsque ces molécules traversent cette membrane au niveau de pores.
L’appareil contient 512 pores et permet de générer des séquences de plusieurs dizaines de kb.
Cet appareil est utilisé conjointement avec le MinIT qui permet l’acquisition des données et le basecalling en temps réel et de manière simultanée.
La capacité théorique de séquençage est de l’ordre de 20 Gb sur les nouvelles flowcell R10.
Les applications sont :
- Séquençage de génomes eucaryotes
- Séquençage de génomes bactériens
- Séquençage d’amplicons longs (10-30 kb, mitochondries…)
- Séquençage d’ARN (RNA-seq, variants structuraux…)
Responsable de ces applications : E. Ponsardin